חיידקים ונגיפים וגם שאר היצורונים המקיפים אותנו מכל עבר, משפיעים על חיינו מכל מיני כיוונים. בבלוג אספר על אלה המוזכרים מדי פעם בחדשות וגם לחדשות מדעיות הקשורות בהם. כמו כן אשתף אתכם גם בתמונות ודיווחים על יצורים גדולים יותר, שבהם אצפה בטבע. בלוג זה גם יהווה ארכיון לחומרים שכתבתי בעבר ורלוונטיים לנושא.

27.10.24

אנטיביוט חדש, Orfamid N, מיוצר על ידי חיידקים שבודדו מלשלשת של אווזים.

 

בשיקגו, שיתוף פעולה חינוכי ומדעי של שני מועדוני נוער (BGCC) עם מעבדת מחקר באוניברסיטת אילינוי, הוביל לגילוי של חיידקי Pseudomonas idahoensis המייצרים אנטיביוט החדש, Orfamid N, שמלבד פעילותו האנטיביוטית כנגד חיידקי Staphylococcus aureus הוא מעכב גידול בתרבית של תאי מלנומה ותאי סרטן שחלות אנושיים.    




בשיקגו,  כדי לקרב את תלמידי התיכון ללימודי המדעים, נבנתה תוכנית של 14 שבועות שבהם מתנסים בני נוער ומכירים נושאים מדעיים שונים לעומק. במסגרת תוכנית זו נוצר הפרוייקט Chicago Antibiotic Discovery Lab, ששילב נערים ונערות ממועדוני נוער (Boys and Girls Clubs of Chicago - BGCC) עם צוות המעבדה של בריאן מרפי (Murphy) באוניברסיטה. 

במסגרת החלק הסביבתי של התוכנית, דגמו הנערים והנערות 14 ממצאים מסביבתם הקרובה: 

המטרה היתה לחפש בדגימות אלה חיידקים מייצרי אנטיביוטיקה.  14 הדגימות הועברו למעבדה. שם בודדו מהן 1195 חיידקים. כל החיידקים נבדקו ליכולתם לעכב גידול בצלחת פטרי של חיידקי Staphylococcus aureus. 

אחד החיידקים, שמקורו היה בדגימת לשלשת של אווזים שנאספה בפארק המקומי (Garfield park lagoone) וכונה BGCFaB3, עיכב משמעותית (בכ-90 אחוזים) את גידול S. aureus  על צלחת פטרי. החיידקים, שזוהו בשיטת ריצוף גנום מלא כ-Pseudomonas idahoensis, גודלו במעבדה בתרחיף של 2 ליטר. החיידקים הופרדו מהמצע, וממנו בודד, בשיטות כימיות,  האנטיביוט שהוא מייצר ונחקר מבנהו הכימי. על סמך מבנהו ודמיונו לקבוצת חומרים מוכרים אחרים כונה האנטיביוט החדש אורפמיד (Orfamid) N. 


אורפמיד N משמאל. מימין - המבנה הבסיסי של האורפמידים -
מוכרים לפחות ששה כאלה הנבדלים באורך ובמבנה השרשרת "השמאלית"

אורפמיד N הוא פפטיד מעגלי (cyclic lipodepsipeptide) המכיל של 10 חומצות אמינו (חלקן בקונפורמציה D, שהיא חריגה ולא קיימת בחלבונים) אליהן מחובר שייר ליפידי. 

במעבדה נבדקה השפעתו של אורפמיד על תרביות תאי אדם שמקורן בתאי מלנומה ותאי סרטן צוואר הרחם. הוא עיכב את הגידול בתאי שתי התרביות. 


המאמר - בכתב העת ACS omega




אין תגובות:

הוסף רשומת תגובה